Trong game Pixel Samurai, bạn sẽ phải giúp một samurai dũng cảm chiến đấu chống lại các băng tội phạm. Trước mặt bạn trên màn hình sẽ hiển thị nhân vật của bạn, người sẽ chạy dọc theo con đường tăng dần tốc độ. Trên con đường của người anh hùng sẽ có nhiều loại chướng ngại vật và cạm bẫy mà các samurai sẽ phải vượt qua tất cả. Khi gặp đối thủ, samurai của bạn sẽ phải tấn công bằng kiếm trên đường chạy và do đó tiêu diệt tất cả các đối thủ gặp phải.