Nhiệm vụ trong Flying Man 3D là tiêu diệt các android được AI thiết kế để tiêu diệt loài người. Để làm điều này, bạn sẽ bắn anh hùng và trong suốt chuyến bay, hãy tăng số lượng người bằng cách thu thập các phần tử tròn có giá trị dương. Nhóm càng đông thì cơ hội chiến thắng càng cao.